Desde los primeros trabajos efectuados por Salvin en 1885 se ha remarcado la importancia zoogeográfica que representa para la avifauna la isla Cozumel ya que en ella, se encuentran especies que se distrubuyen en las Antillas y que no se encuentran en otros sitios de México, también presenta subespecies endémicas de especies Antillanas que solo se encuentran en Cozumel y las especies migratorias que pasan por Cozumel son típicamente Antillanas.  Además de la importancia que representan las especies endémicas y residentes, para algunas de las cuales, desde el trabajo de Griscom en 1926 eran reportadas como notablemente escasas o raras.

Una parte muy importante para la realización de este trabajo fue la información de las colectas que se encuentran resguardadas en las Colecciones Ornitológicas y Museos de Historia Natural. Como lo señala Winker (1996) los ejemplares que se encuentran en las Colecciones representan una estimación de la biodiversidad y el estudio y análisis de su registro es importante para lograr su conservación.

Sabemos que en diversos lugares del Mundo, se han observado durante los últimos años drásticos cambios en la composición de las especies que originalmente habitaban dichos sitios. Estos cambios, han sido el resultado en algunos casos de causas naturales y en otros de causas provocadas por el desarrollo de diversas actividades humanas. La isla Cozumel, se ha mantenido “relativamente” aislada del rápido desarrollo y deterioro a gran escala que se ha presentado en muchas otras zonas del estado de Quintana Roo y mantiene una parte importante de sus hábitat naturales inalterados y/o bajo alguna protección. Sin embargo, esto no significa que haya logrado escapar del daño que por una parte, representan el desarrollo y las actividades turísticas y por otro, el daño que los fenómenos naturales provocan, como lo es para la isla , el paso de los huracanes. La suma de estos dos eventos ha afectado de manera importante la presencia y la abundancia de algunas especies, tales como Toxostoma guttatum y Crax rubra griscomi  especie y subespecie endémicas que posiblemente representan las especies más amenazadas en todo México y de muchas otras especies residentes y migratorias que anteriormente eran abundantes y que apartir de los 90’s sus poblaciones han mostrado drásticos decrementos (Howell, 2004).

Aunque es imposible cuantificar los cambios en la abundancia de individuos de cada especie debido a la falta de datos, sabemos por reportes de los pobladores locales, que muchas especies ya no se observan con la misma frecuencia o en la misma cantidad en que hace algunos años se encontraban, tales como el caso de Crax rubra (Geat Curassow),  Amazona xantholora (Yellow-lored Parrot), Cardinalis cardinalis (Northern Cardinal) y Leptotila jamaicensis (Caribbean Dove) entre otras.

Para las especies migratorias conocemos que la isla representa un sitio importante de parada ya sea para pasar en ella el invierno o para descansar y alimentarse antes de continuar con su migración hacia otros sitios de Centro, Sudamérica y otras islas del Caribe.  Al hacer la comparación del número de especies migratorias que paran y/o pasan por la isla contra los datos que se tienen para otras islas caribeñas, conocimos que Cozumel es una de las islas que a pesar de su pequeño tamaño alberga la mayor variedad de especies invernantes así como de especies en tránsito. Para Cozumel se han reportado más especies migratorias de todas las que se han reportado para las Bahamas y las Grandes Antillas (Wunderle & Waide, 1993).

De esta manera, aunque la isla mantiene una gran parte de su extensión en buen estado de conservación, debemos considerar que al tratarse de un sitio turístico, los planes de desarrollo y crecimiento siempre estarán presentes. Por ello, para los trabajos que se desarrollen en el futuro será importante incluir trabajo conjunto con las autoridades locales y con las organizaciones interesadas en la conservación de los recursos de la isla, como lo es la Fundación de Parques y Museos, así como con la comunidad local para plantear con ellos actividades y programas de manejo y conservación que le den a la isla la posibilidad de seguir albergando la interesante avifauna que hasta ahora ha mantenido. El presente trabajo pretende servir como base para las investigaciones ornitológicas que puedan desarrollarse en el futuro.